Nelson Bonilla

Alianza F.C.

El futbolista fue convocado por el entrenador Miguel Soriano para el compromiso de la jornada 15 del Torneo Apertura 2009. El juego se desarrolló el 11 de noviembre donde su equipo enfrentó al Alacranes del Norte en el Estadio Cuscatlán. Bonilla tuvo su debut como profesional, después de ingresar de cambio al minuto 65 , además debutó con un gol en la jornada 2 del apertura 2012 al minuto 51'. El marcador terminó en victoria con cifras de 2-0. Posteriormente sería tomado en cuenta en las alineaciones del entrenador.

FC Viitorul Constanța

El delantero sumó su primer equipo internacional tras fichar, en julio de 2014 con el FC Viitorul Constanța, de la Liga I de Rumania, llegando a un acuerdo de una temporada. El 1 de agosto de 2014, Bonilla debutó oficialmente con el club en la jornada dos del campeonato rumano entrando de sustitución a los 85' minutos en la derrota de su equipo ante el Rapid Bucarest. Él consiguió su primer gol para el club en la jornada 10, anotando el único gol de su equipo en la victoria contra el FC Astra 1-0. Bonilla consiguió su primer doblete en el fútbol europeo en el próximo encuentro ante el Suporter Club Oțelul Galați. Durante toda de la temporada fue un referente importante para el club, y siendo titular en casi todos los partidos. A mediados de 2015 es puesto transferible por el técnico Gheorghe Hagi, esto por aspectos extra deportivos con el jugador, llegando a un acuerdo con el club de residir su contrato de un año que había renovado a finales de mayo. Terminando la temporada como el mejor goleador del equipo con un monto de 7 goles y 24 partidos disputados. A mediados de 2015 el Petrolul Ploiești, indicó su interés por Bonilla para sumarlo a sus filas para la temporada 2015-2016 pero no llegaron a un acuerdo.

Zira FK

El 31 de agosto de 2015 se confirmó que Bonilla, como agente libre, firmó un contrato de dos años con el club de fútbol de Azerbaiyán Zira FK de la Liga Premier de Azerbaiyán. Recibió la camiseta con el número 9. Su encuentro de debut se llevó a cabo el 13 de septiembre, contra el Sumqayit FK en la jornada cuatro del campeonato. En esa ocasión, Nelson entró de titular y siendo sustituido por Rihairo Meulens al minuto 68', y el marcador culminó en igualdad de 0-0. El 3 de octubre, consiguió su primer gol en el club ante el Neftchi Baku PFK, el resultado fue de victoria 2-0. Bonilla acumuló 2,404 minutos en una temporada con el zira. En total tuvo 29 apariciones y anotó 14 goles, siendo el goleador del club y el segundo máximo goleador de la liga, marcando 8 dobletes y un hat trick este ante el Rəvan el 10 de abril de 2016, mientras que su conjunto terminó segundo en el campeonato con 62 puntos a 22 del líder y campeón Qarabağ con 82 puntos.

Clube Desportivo Nacional

El 20 de mayo de 2016 se hace oficial su fichaje por el Clube Desportivo Nacional de Portugal, con un contrato de 3 temporadas por € 100 mil de euros. Debutó oficialmente con el club de ||Madeira|| el 21 de agosto, en el Estádio Municipal de Arouca contra el F.C. Arouca. En esa ocasión, Bonilla entró de cambio por el venezolano Jhonder Cádiz al minuto 31', y el marcador culminó en derrota por 2-0. Anotó su primer gol con el nacional en la jornada cuatro el 10 de septiembre, contra el Os Belenenses a los 7' minutos en la derrota de su equipo por 2-1.

Selección nacional

Selección	Año	Partidos	Goles
SLV El Salvador
	2012	7	2
	2013	4	1
	2014	2	1
	2015	10	3
	2016	6	3
	2017	9	2
	2018	1	1
	2019	6	3
	2020	0	0
	2021	2	0
	2022	10	3
	2023	0	0
	2024	8	1
Total en su carrera		65	20
Estadísticas hasta el 18 de noviembre de 2024.

Goles internacionales

Núm.	Fecha	Lugar	Rival	Gol	Resultado	Competición
1	26 de mayo de 2012	Estadio Cotton Bowl, Dallas, Estados Unidos	MDA Moldavia	1-0	2-0	Amistoso
2	11 de agosto de 2012	StubHub Center, Carson, Estados Unidos	GUA Guatemala	1-0	1-0	Amistoso
3	27 de enero de 2013	Estadio Nacional, San José, Costa Rica	BLZ Belice	1-0	1-0	Copa Centroamericana 2013
4	18 de noviembre de 2014	Estadio Independencia, Estelí, Nicaragua	Nicaragua Nicaragua	2-0	2-0	Amistoso
5	11 de junio de 2015	Complejo Deportivo Parque Warner, Basseterre, isla de San Cristóbal	SKN San Cristóbal y Nieves	2-2	2-2	Eliminatorias Rusia 2018
6	16 de junio de 2015	Estadio Cuscatlán, San Salvador, El Salvador	SKN San Cristóbal y Nieves	2-0	4-1	Eliminatorias Rusia 2018
7	16 de junio de 2015	Estadio Cuscatlán, San Salvador, El Salvador	SKN San Cristóbal y Nieves	4-1	4-1	Eliminatorias Rusia 2018
8	25 de marzo de 2016	Estadio Cuscatlán, San Salvador, El Salvador	HON Honduras	2-2	2-2	Eliminatorias Rusia 2018
9	28 de mayo de 2016	Robert F. Kennedy Memorial Stadium, Washington D. C., Estados Unidos	PER Perú	1-2	1-3	Amistoso
10	6 de septiembre de 2016	Estadio BC Place, Vancouver, Canadá	CAN Canadá	1-2	1-3	Eliminatorias Rusia 2018
11	9 de julio de 2017	Estadio Qualcomm, San Diego, Estados Unidos	MEX México	1-1	1-3	Copa Oro 2017
12	16 de julio de 2017	Alamodome, San Antonio, Estados Unidos	JAM Jamaica	1-0	1-1	Copa Oro 2017
13	13 de octubre de 2018	Estadio Cuscatlán, San Salvador, El Salvador	BRB Barbados	1-0	3-0	Clasificación para la Liga de Naciones Concacaf 2019-20
14	23 de marzo de 2019	Estadio Cuscatlán, San Salvador, El Salvador	JAM Jamaica	1-0	2-0	Clasificación para la Liga de Naciones Concacaf 2019-20
15	17 de junio de 2019	Independence Park, Kingston, Jamaica	CUW Curazao	1-0	1-0	Copa Oro 2019
16	7 de septiembre de 2019	Estadio Cuscatlán, San Salvador, El Salvador	LCA Santa Lucía	3-0	3-0	Liga de Naciones de la Concacaf 2019-20

Dobletes y tripletes

Nelson Bonilla ha anotado en su carrera un total de ocho dobletes y un hat-tricks o tripletes (dato desactualizado) en partidos oficiales. Los cuatro dobletes han sido con el Zira FK, uno con FC Viitorul, dos con Alianza FC y uno con la Selección de El Salvador. Además, en una ocasión ha sido capaz de anotar tres goles con el Zira FK. En total, sus dobletes y tripletes le han otorgado cuarenta y tres goles.

Datos desactualizados, datos según ultimo partido jugado el 28 de marzo de 2018.

Dobletes y tripletes
	Fecha	Lugar	Equipo	Rival	Goles	Resultado	Competición
2	10/09/2011	Estadio Juan Francisco Barraza, San Miguel	Alianza Futbol Club	Club Deportivo Águila		2 - 1	Torneo Apertura 2011
2	22/07/2012	Estadio Cuscatlán, San Salvador	Alianza Fútbol Club	Santa Tecla Fútbol Club		7 - 1	Torneo Clausura 2012
2	18/01/2014	Estadio Stadionul Farul, Constanța, Rumania	FC Viitorul Constanța	Suporter Club Oțelul Galați		3 - 0	Liga I 2014/15
2	18/01/2014	Estadio Cuscatlan, San Salvador, El Salvador	Selección de El Salvador	San Cristóbal y Nieves		4 - 1	Eliminatorias Rusia 2018
2	28/10/2015	Zira Olympic Sport Complex Stadium, Bakú, Azerbaiyán	Zira FK	Käpäz Ganja		2 - 2	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
2	02/12/2015	Estadio AZAL, Bakú, Azerbaiyán	Zira FK	AZAL PFC		1 - 2	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
2	15/02/2016	Bayil Stadium, Bakú, Azerbaiyán	Zira FK	Ravan Baku FK		1 - 2	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
2	13/03/2016	Estadio Municipal de Qabala, Qabala, Azerbaiyán	Zira FK	Gabala FC		1 - 2	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
3	10/04/2016	Bayil Stadium, Bakú, Azerbaiyán	Zira FK	Ravan Baku FK		0 - 4	Liga Premier de Azerbaiyán 2015-16
2	10/02/2018	Thupatemee Stadium, Bangkok, Tailandia	Air Force Central	Sukhothai F.C.		1 - 2	Liga de Tailandia 2018
2	24/02/2018	Chon Buri Stadium, Chonburi, Tailandia	Chonburi F.C.	Sukhothai F.C.		1 - 2	Liga de Tailandia 2018
2	28/03/2018	Sattahip Stadium, Sattahip, Tailandia	Navy F.C.	Sukhothai F.C.		3 - 2	Liga de Tailandia 2018

Campeonatos nacionales

N.º	Título	Club	País	Año
1	Torneo Clausura 2011	Alianza Fútbol Club	El Salvador El Salvador	2011